鸡的消化道相对较短，肠道黏膜屏障脆弱。在集约化养殖条件下，与长消化道动物相比更加容易受到不良微生物的侵害，导致各类疾病的发生。使用寡糖饲料添加剂是防治肠道疾病、改善肉鸡和蛋鸡生产性能的有效手段之一。
在仔猪日粮中添加寡糖饲料添加剂，可促进仔猪肠道发育，改善肠道健康，降低腹泻率，提高仔猪生长速度和饲料转化率。对于哺乳期仔猪，添加寡糖饲料添加剂有助于建立益生菌的优势菌群；对断奶仔猪，可以改善因自身消化酶分泌、日粮的抗原性等因素导致的腹泻、生长受阻等不利影响。研究表明，在母猪日粮中使用寡糖饲料添加剂，可以改善肠道健康，提高母猪免疫力和繁殖性能。
寡糖饲料添加剂可改善肉羊、肉牛等肉用反刍动物的增重速度，提高胴体净肉率，改善肉质。对产奶反刍动物，寡糖饲料添加剂可以提高产奶量、延长产奶高峰，提高乳脂率、降低奶中体细胞数量、改善乳成分。并对防治乳房炎和繁殖疾病也有一定作用。对于消化道发育尚不健全的犊牛，使用寡糖添加剂具有促进犊牛胃肠道菌群建立、调节菌群平衡的作用，减少犊牛下痢的发生。此外，使用寡糖饲料添加剂，对犊牛的增重等具有促进作用。
寡糖饲料添加剂可改善水产动物微生态平衡、促进生长发育，发挥防治疾病和提高生产性能的作用。益生菌可在鱼类肠道内定植，促进鱼的生长发育，提高抗病力。饲用寡糖饲料添加剂可降低对虾的发病率，提高成活率与产量。
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